В областта на товарните превози адекватната към пазарните тенденции стратегия включва:
• Провеждане на собствена корпоративна политика, тясно свързана с маркетинговата стратегия в различните пазарни сегменти;
• Запазване и възвръщане на превозите на масови товари чрез подобряване качеството на предлаганите услуги;
• Увеличаване на международните железопътни превози (внос-износ-транзит);
• Развитие на комбинираните превози (контейнерни совалки и блок-влакове във вътрешно и международно съобщение, Ro-La превози);
• Оптимизиране на системата вагонни пратки;
• Постепенно подновяване и модернизация на вагонния парк.

В областта на тарифната политика БДЖ “ЕАД” предлага на своите клиенти:
• При превози през гранични гари с вагони, собственост на БДЖ, превозните цени се изчисляват с 20% намаление на цените по Таблица І на ТЕА.
• При износ през гранични гари с частни вагони превозните цени се изчисляват с 40% намаление на цените по Таблица І на ТЕА (при износ през Варна фериботна по Таблица ІБ на ЕТПТ).
• При превоз на транзитни товари от пристанище до гранична гара или обратно, с вагони собственост на БДЖ, Македонските железници или Сръбските железници, се предоставят 52% намаление от цените по Таблица II на ТЕА, а с частни вагони се предоставят 62% намаление от цените по Таблица II на ТЕА;
• При превоз на транзитни товари пристанище – пристанище, се предоставят 20% намаление от цените по Таблица ІА и ІА-1 на ЕТПТ;
• Използването на жп (комбиниран) транспорт при превозите внос/износ от/за Македония с претоварване на/от автомобил във вътрешна гара се поощрява посредством 10% допълнително намаление на превозните цени;
• При организация на превозите с блок-влак, с минимална брутна маса 950 тона и минимално количество 10 000 тона, се предоставят 6% допълнително намаление при внос и 5% допълнително намаление при износ;
• При превоз на всички видове товари с вагон-зърновози и вагон-торовози, собственост на „БДЖ” ЕАД, увеличението, съгласно §20 на ЕТПТ и ТЕА, се прилага в размер на 10%, вместо предвидените 20%;
• При договаряне на логистични схеми за превоз на ГТК от внос и/или за износ през пристанище с блок-влак, се предоставя до 20% намаление на цените по Специалната тарифа за превоз на ГТК към ЕТПТ;
• При договаряне на логистични схеми и осигуряване на товари за превоз с железнични вагони в двете посоки (пълно-пълно), на превозните цени се прилага намаление от 20%;